有三組光源，白光光源一組，紫外光源兩組分別是365nm和254nm。

　　首先是白光光源，通常作為系統(tǒng)照明光源使用，即放置或調(diào)整DNA膠或蛋白膠位置，或在對(duì)鏡頭調(diào)整聚焦時(shí)使用，當(dāng)然在對(duì)非透明材質(zhì)的蛋白膠或其他成像物質(zhì)進(jìn)行成像時(shí)也需開(kāi)啟反射白光。

　　二個(gè)是：254nm這是一個(gè)比較常用的檢測(cè)波長(zhǎng)，大多數(shù)含有苯環(huán)的有機(jī)化合物在此有吸收，不過(guò)這樣它的特征性就不強(qiáng)了！而且會(huì)引來(lái)很多干擾，所以還是建議對(duì)不同物質(zhì)選擇不同的檢測(cè)波長(zhǎng)，一是提高靈敏度和選擇性，二是減少不必要的干擾。無(wú)色的成分在245-365nm的紫外燈下檢視可以看到在這個(gè)范圍內(nèi)存在光吸收的成分所發(fā)出的熒光。

　　三個(gè)：365nm光源主要適用于制備觀察以及切割條帶，減少對(duì)DNA的破壞，并減小對(duì)人的傷害。

　　紫外反射燈源，使用并不廣泛，只是在非透明材質(zhì)的DNA跑膠載體如紙層析等的成像才需要使用。往往比較常用的還是透明的瓊脂糖凝膠與聚丙烯酰胺凝膠，透射光源*可以滿(mǎn)足。

　　還有一個(gè)不常用的302nm波長(zhǎng)，主要用于DNA膠拍攝，由于DNA常用的熒光染料是EB（即Ethidiumbromide，溴化乙錠），而用標(biāo)準(zhǔn)302nm紫外光透射儀激發(fā)并放射出橙紅色信號(hào)，可用拍攝到。